Печать

Несмотря на почти 80-летний период изучения вируса клещевого энцефалита (ВКЭ), в проблеме клещевого энцефалита (КЭ), на наш взгляд, есть еще много нерешенных вопросов. Важнейшей фундаментальной задачей является понимание механизмов эволюции вируса, а также ответы на вопросы: как, когда и откуда распространился ВКЭ по территории Евразии. Слушая доклады конференций, а также принимая во внимание последние публикации по этой тематике, понимаешь, что единого мнения среди специалистов нет. Складывается необычная ситуация, когда одновременно существует несколько альтернативных точек зрения на одну и ту же проблему. Так, например, доминирующая в настоящее время гипотеза о распространении ВКЭ как о клинальном продвижении вируса с востока на запад Евразии предполагает местом происхождения ВКЭ Дальний Восток (Zanotto, P.M., et al., 1995). Противоположная точка зрения была недавно высказана новосибирскими учеными, которые на основе анализа фрагмента нуклеотидной последовательности, кодирующей белок E, заключили, что местом происхождения ВКЭ является Западная Европа, а распространение ВКЭ, вероятно, проходило с запада на восток Евразии (Subbotina, E.L. and V.B. Loktev, 2012). И, наконец, существует третий компромиссный взгляд на происхождение и эволюцию ВКЭ, который также был представлен научной общественности совсем недавно. Его авторы на основе анализа полногеномных последовательностей ВКЭ из GenBank считают, что центром происхождения была Сибирь, а распространение ВКЭ шло в двух направлениях - как на запад, и на восток (Heinze, D.M. et al., 2012). При таких взаимоисключающих вариантах сценария эволюции ВКЭ наблюдается и сильное расхождение в оценке времени происхождения ВКЭ, которое варьирует от 2,25 до 5-7 тыс. лет. При этом авторы последних двух гипотез использовали одни и те же нуклеотидные последовательности и одно и то же программное обеспечение для определения времени дивергенции.

Мы решили подойти к этой проблеме с другой стороны и рассмотреть эволюцию ВКЭ не как следствие последовательного равномерного накопления мутаций (филетическая эволюция), а как процесс быстрого накопления нуклеотидных замен (квантовый скачок), чередующийся с периодами относительно равномерного изменения. Квантовые скачки при этом приводят к образованию дискретных филогенетических групп - субтипов вируса. Данный подход принципиально изменяет подход к оценке возраста вируса: её расчет становится возможен только в пределах субтипа (точнее, в пределах кластерона-основателя), а время квантового скачка, требующегося для образования субтипа, не учитывается ввиду его высокой скорости. При таком подходе возраст вируса снижается до 600 лет. Предложенная гипотеза, безусловно, требует наличия фактора отбора, который мог бы привести в квантовому скачку. В качестве такого фактора мы полагаем смену основного хозяина ВКЭ - клеща. Действительно, европейский субтип мог возникнуть при переходе вируса с Ixodes persulcatus на I. ricinus, а  сибирский и дальневосточный могли образоваться вследствие перехода вируса между дальневосточными и сибирскими популяциями I. persulcatus.

1.1. Понятие «кластерон»

1.2. Территориальное распределение кластеронов ВКЭ-Сиб

1.3. Расчет возраста отдельных кластеронов и ВКЭ в целом

1.4. Кластеронные структуры субтипов ВКЭ

1.5. Кластеронная структура ВКЭ и ее важные характеристики (пока недоступен)