26.12.2016 Уважаемые друзья и гости сайта! Сотрудники лаборатории молекулярной генетики от всей души поздравляют вас с наступающим Новым годом и Рождеством! Желаем вам здоровья и благополучия! Только праздничного настроения, оптимизма, и правильных решений во всех жизненных ситуациях. Пусть 2017 год будет переломным, с радостными новостями и приятными событиями!
25.10.2016 Уважаемые друзья и гости! Мы очень гордимся, что руководитель нашей Лаборатории Ковалев Сергей Юрьевич был признан Лучшим преподавателем Уральского федерального университета в номинации "Доцент года". Мы, т.е. сотрудники и благодарные выпускники, считаем эту награду более чем заслуженной, от всей души поздравляем Сергея Юрьевича и желаем новых педагогических успехов!
10.10.2016 Уважаемые друзья и гости сайта! Как было обещано ранее, мы публикуем дату и место проведения защиты диссертации на соискание степени доктора биологических наук Ковалева Сергея Юрьевича, а также сведения об оппонентах и ведущей организации.
Работа выполнена в Федеральном государственном автономном образовательном учреждении высшего профессионального образования «Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б.Н. Ельцина».
Официальные оппоненты:
Игнатьев Георгий Михайлович, д.м.н., профессор, ФГУП «Санкт-Петербургский Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток и Предприятие по производству бактерийных препаратов» ФМБА России, заместитель директора по экспериментально-аналитической работе.
Лукашев Александр Николаевич, д.м.н., профессор РАН, Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов имени М.П. Чумакова», зав. лабораторией молекулярной биологии.
Платонов Александр Евгеньевич, д.б.н., профессор, ФБУН Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, г. Москва, зав. лабораторией эпидемиологии природно-очаговых инфекций.
Ведущая организация: Федеральное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора).
Защита состоится «26» января 2017 г. в 12 часов на заседании диссертационного совета Д 001.035.01 при Федеральном государственном бюджетном научном учреждении «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова» по адресу: 105064, Москва, Малый Казенный переулок, д.5а.
С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке и на сайте ФГБНУ НИИВС им. И.И. Мечникова (105064, Москва, Малый Казенный переулок, д.5а), http://www.instmech.ru
29.09.2016 Уважаемые друзья и гости сайта! По этой ссылке вы можете ознакомиться с уже опубликованной нашей последней статьей "Baltic lineage of tick-borne encephalitis virus: A putative evolutionary pathway" в pdf формате
http://authors.elsevier.com/a/1ToF9,gioauQD~
01.09.2016 Уважаемые студенты и преподаватели! Поздравляем с началом учебного года! Впереди трудный, но захватывающий учебный год! Вас будут ждать множество неожиданных событий, ярких впечатлений и трудных решений. Будьте к этому готовы!
25.07.2016 Уважаемые друзья и коллеги! Для всех, кто интересуется нашими работами, сообщаем хорошую новость - только что вышла наша статья Baltic lineage of tick-borne encephalitis virus: A putative evolutionary pathway в журнале Ticks and Tick-borne Diseases (пока в виде Accepted Manuscript). В данной статье мы проследили возможный эволюционный путь и распространение штаммов Балтийской филогенетической линии ВКЭ.
Abstract
Tick-borne encephalitis virus (TBEV) is transmitted by ixodid ticks and has three subtypes. The most genetically heterogeneous and widely distributed is the Siberian subtype which is subdivided into two main phylogenetic lineages, Asian (TBEV-SibAsia) and Baltic (TBEV-SibBaltic). According to the hypothesis of quantum evolution of TBEV (Kovalev et al., 2014), TBEV-SibAsia originated about 370 years ago in Siberia, but the question concerning the time and place of origin of TBEV-SibBaltic is still to be solved. In the present paper, the sequences of a gene E fragment of 20 newly obtained TBEV-SibBaltic strains and 164 sequences of TBEV-SibBaltic from GenBank were analyzed. The clusteron approach applied to TBEV-SibBaltic allowed the identification of three new clusterons. We revealed three clades of TBEV-SibBaltic, each characterized by a certain geographical distribution, and estimated their evolutionary ages. The oldest clade was Balt I, which presumably originated in North-West Russia and the Baltic countries about 300 years ago as a result of human activity, and then gave rise to the other clades in the Urals and West Siberia. The European subtype of TBEV and TBEV-SibBaltic may have originated simultaneously from the clusteron-founder 3A of TBEV-SibAsia, the former through the adaptation of the virus to Ixodes ricinus, the latter – to a European subpopulation of Ixodes persulcatus. The use of the clusteron approach complemented with the results of phylogenetic analysis, data on the geographical distribution of the virus, the population structure of ticks, and the historical evidence allows us to estimate evolutionary pathways of the subtypes and phylogenetic lineages of TBEV.
25.07.2016 Обновление фотоархива: как мы съездили на Иннопром-2016
18.06.2016 15 июня состоялась защита выпускных квалификационных работ бакалавров и магистерских диссертаций студентов кафедры физиологии и биохимии растений. Поздравляем выпускников с защитой и желаем им дальнейших успехов во всех сферах! Некоторые фотографии с защиты можно найти в разделе Фотоархив.
26.05.2016 По состоянию на 23 мая 2016 г. на территории Свердловской области зарегистрировано 11313 пострадавших от присасывания клещей, что в целом соответствует среднему многолетнему уровню. А мы продолжаем сборы клещей в соседних областях, которые изучены гораздо меньше Свердловской. Например, недавно мы совершили поездку в Тюменскую область (фотографии из Тюмени).
11.05.2016 Число жертв клещей на Урале перевалило за семь тысяч!
07.05.2016 Уважаемые друзья, коллеги и читатели нашего сайта! Поздравляем Всех с праздником!
В этот день мы выражаем глубокую признательность и уважение всем героям, мы не забудем их подвига никогда. Хочется пожелать Вам здоровья, счастья и добра!
30.04.2016 Уважаемые друзья, коллеги и читатели нашего сайта! Поздравляем Всех с праздником!
В день, символизирующий солидарность и дружбу всех людей, желаем весеннего тепла, энтузиазма, побольше ярких идей и творческих успехов во всех начинаниях. Пусть эти дни пройдут в бодром, веселом настроении, ярких событиях, в кругу близких и родных. Здоровья, счастья, любви.
26.04.2016 Когда холодно или идет дождь, клещи отдыхают ;)
25.04.2016 Новые сводки с клещевых фронтов.
21.04.2016 Вот и начался новый клещевой сезон - в этом году в связи с необычно теплой погодой раньше обычного! В начале этой недели в Свердловской области было зарегистрировано уже 773 случая укуса клещей. Берегитесь клещей, но если уберечься не получилось, помните, что есть заинтересованные в них люди!
14.04.2016 Уважаемые друзья и коллеги! Для всех, кто следит за нашими работами, мы рады сообщить хорошую новость - только что вышла наша статья
Ковалев С.Ю., Мухачева Т.А. Унификация молекулярно-эпидемиологических исследований клещевого энцефалита // Вопросы вирусологии. 2016. - Т.61. - №2. - С. 89-95.
Резюме
Применение молекулярно-генетических методов и подходов в эпидемиологических исследованиях стало настоящим прорывом в понимании закономерностей, путей и механизмов распространения возбудителей инфекций. Однако отсутствие стандартных методов исследования приводит к несопоставимости форматов полученных результатов. В целях унификации методов предлагается выбрать один фрагмент вирусного генома, секвенирование которого было бы необходимым и достаточным условием для проведения молекулярно-эпидемиологических исследований клещевого энцефалита (КЭ). Кандидатом на эту роль может быть фрагмент гена Е длиной 454 нуклеотидов, представленный наибольшим количеством последовательностей в базе данных GenBank. Кроме того, на основе кодируемой этим фрагментом аминокислотной последовательности была разработана система дифференциации вируса КЭ (ВКЭ) на структурные единицы - кластероны (Kovalev S., Mukhacheva T., 2013). На примере природных очагов Среднего Урала была показана информативность кластеронного подхода к изучению генетической структуры популяции ВКЭ-Сиб. Каждый очаг КЭ оказался уникальным как по количественному, так и по качественному составу кластеронов. При этом наибольшее их разнообразие наблюдалось на юге Среднего Урала в зоне Транссибирского пути, что отражает историю колонизации этой территории, тесным образом связанную с дорогами из Сибири в европейскую часть России. Было выявлено три кластерона возрастом не более 50 лет, присутствие которых может свидетельствовать об активном эволюционном процессе в популяциях ВКЭ-Сиб. В свою очередь тип их территориального распределения указывает на решающую роль антропогенного фактора в распространении ВКЭ (Kovalev S., Mukhacheva T., 2014). Кластеронный подход позволяет учесть не только генетическую, но и фенотипическую изменчивость вируса, и должен рассматриваться скорее в качестве дополнения, а не альтернативы филогенетическому анализу. Помимо научного предлагаемый подход может иметь и прикладное значение, например использоваться региональными службами Роспотребнадзора для эпидемиологического мониторинга КЭ. Унификация исследований на основе одного стандартного генетического маркера позволит объединить усилия исследователей из разных регионов России и других стран в изучении КЭ.
06.01.2016 Уважаемые друзья, коллеги и гости сайта! Лаборатория молекулярной генетики поздравляет с наступившим Новым Годом! Процветания, творческих успехов, а главное здоровья в 2016! Пусть сбудутся ваши мечты и реализуются намеченные планы!!!
27.11.2015 Коллектив ЛМГ от всей души поздравляет сотрудника лаборатории, м.н.с. Татьяну Александровну Мухачеву с блестящей защитой кандидатской диссертации! Ура-а-а!!! И желает ей здоровья, дальнейших творческих успехов, а главное, не останавливаться на достигнутом!!!
26.11.2015 
Коллектив ЛМГ УрФУ от всей души поздравляет Марию Михайлищеву с Призовым (Вторым) местом на XVIII Областном конкурсе студенческих научных работ "Научный Олимп" в номинации "Естественные науки"!!! Желаем процветания и успехов в профессиональной деятельности!
11.11.2015 Уважаемые друзья и коллеги! Результаты многолетней работы ЛМГ УрФУ в области молекулярной эпидемиологии природно-очаговых инфекций теперь обобщены в виде кандидатской диссертации Т.А. Мухачевой, текст которой вместе с авторефератом размещены на сайте диссертационного совета ДМ004.019.01 Института экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН (г. Пермь): http://www.iegm.ru/diss/docc/doc_97.html
Защита диссертации на тему «Молекулярно-генетическая характеристика возбудителей иксодового клещевого боррелиоза в природных очагах на территории России» состоится 27 ноября 2015.
Кроме того на сайте НИИ Полиомиелита и вирусных энцефалитов (г. Москва) размещена докторская диссертация С.Ю. Ковалева на тему "Происхождение, распространение и эволюция вируса клещевого энцефалита", ознакомиться с текстом диссертации можно по ссылке.
Защита этой диссертации состоится в следующем году, предположительно весной. Точную дату сообщим позднее.
Если при чтении выше названных трудов возникнут вопросы или комментарии - пишите, мы постараемся на них ответить.
25.09.2015 Уважаемые друзья и коллеги! Для всех, кто следит за нашими работами, мы рады сообщить хорошую новость - только что вышла наша статья, в которой мы в соавторстве в нашими эстонскими коллегами описываем обнаружение в природе гибридов клещей Ixodes persulcatus и Ixodes ricinus молекулярно-генетическими методами:
Kovalev S.Y., Golovljova I.V., Mukhacheva T.A. Natural hybridization between Ixodes ricinus and I. persulcatus ticks evidenced by molecular genetics methods // Ticks and Tick-borne Diseases. - 2015. - DOI 10.1016/j.ttbdis.2015.09.005.
The recently shown phenomenon of natural hybridization between Ixodes persulcatusand I. pavlovskyi ticks ( Kovalev et al., 2015) stimulated similar studies in the sympatric zones of other tick species. In the present paper, 265 I. ricinus and I. persulcatus ticks from Estonia were subjected to a search for interspecific hybrids based on nuclear (ITS2) and mitochondrial (cox1) markers as well as morphological features. Surprisingly, only 72.1% of ticks morphologically identified as I. ricinus actually were I. ricinus both at nuclear and mitochondrial markers, while the accuracy of morphological species identification for I. persulcatus was 99.3%. Among ticks morphologically identified as I. ricinus, 24.6% turned out to be interspecific hybrids and 3.3% were I. persulcatus. Generally, about 11% of the individuals studied were shown to be interspecific hybrids with different levels of nuclear DNA introgression. The analysis of hybrid populations proved the mating pair female I. ricinus x male I. persulcatus to form hybrids more efficiently, then female I. persulcatus x male I. ricinus. The same trend can be observed for backcrosses preferentially mating with I. ricinus. Hybridization between I. ricinus andI. persulcatus proved the existing view about their reproductive isolation to be untenable. Interspecific hybridization occurring between both closely (I. persulcatus and I. pavlovskyi) and more distantly (I. ricinus and I. persulcatus) related Ixodes species could introduce novel alleles that modify vector competence, host use or the ability to exploit diverse microhabitats.