30.10.2013 Искренне поздравляем выпускницу ЛМГ Жанну Меркушину с победой в номинации "Специальная премия" на XVI Областном конкурсе студенческих научных работ "Научный Олимп!!! Желаем процветания и успехов в профессиональной деятельности!
13.09.2013 Уважаемые друзья, коллеги и гости сайта! Сообщаем Вам, что сегодня была опубликована (пока в электронном виде) наша новая статья, которая является второй частью "саги", посвященной изучению популяционной структуры вируса клещевого энцефалита, основанной на кластеронном подходе. С текстом можно ознакомиться по ссылке ниже:
Clusterons as a tool for monitoring populations of tick-borne encephalitis virus
Sergey Y. Kovalev and Tatyana A. Mukhacheva
Article first published online: 13 SEP 2013 | DOI: 10.1002/jmv.23732
Abstract
Tick-borne encephalitis (TBE) is a natural focal viral neuroinfection that is widespread in the temperate zone of Eurasia. Knowledge of the genetic structure of tick-borne encephalitis virus (TBEV) populations is important for understanding, not only the origin and evolution of the virus, but also the formation and maintenance of natural foci. A new approach to the differentiation of TBEV strains within subtype, with clusterons as the basis of analysis, has recently been proposed. In the present study, the genetic structure of TBEV-Sib populations has been investigated based on 387 strains isolated in the Middle Urals (Sverdlovsk region). Fourteen of the 18 currently known TBEV-Sib clusterons were identified. They belong to the Asian and Eastern European (Baltic) groups. It was shown that each TBE foci could be characterized by a unique clusteron profile. Three clusterons that emerged within the last 50 years have been identified which implies an active evolutionary process in the TBEV-Sib populations. The greatest diversity of clusterons was observed in the south of the Middle Urals along the Trans-Siberian Way. Such a pattern could reflect the history of colonization of the area and is closely related to the roads passing from Siberia to the European part of Russia through the Urals. In this article, the principles of continuous monitoring in the regional and local TBE foci are proposed, based on the quantitative and qualitative analysis of TBEV-Sib clusteron profiles.
J. Med. Virol. © 2013 Wiley Periodicals, Inc.
01.07.2013 Искренне поздравляем выпускниц ЛМГ Жанну Меркушину и Ирину Цой с завершением учебы в УрФУ и получением бакалаврского и магистерского дипломов!!! Желаем успехов в профессиональной деятельности!
24.06.2013 Поздравляем коллектив ЛМГ с 3-х летним грантом РФФИ-Урал 13-04-96045 р_урал_а "Унификация исследований генетического разнообразия возбудителей клещевых инфекций как основа мониторинга природных очагов Среднего Урала"!
27.04.2013 Поздравляем Институт естественных наук с 1 местом в рейтинге институтов УрФУ! Мы рады, что тоже внесли свою лепту в эту победу!
21.04.2013 Уважаемые друзья, коллеги и гости сайта! Рады сообщить Вам, что на днях была опубликована (пока в электронном виде) наша новая статья, на сей раз посвященная изучению филогении боррелий на территории всей нашей огромной Родины. С текстом можно ознакомиться по ссылке ниже
Mukhacheva T.A., Kovalev S.Y. Multilocus sequence analysis of Borrelia burgdorferi s.l. in Russia // Ticks Tick-borne Dis. - 2013. - DOI 10.1016/j.ttbdis.2013.02.004.
Abstract
Borrelia burgdorferi sensu lato is a species complex that includes the causative agents of Lyme borreliosis (LB). Classification of the complex was greatly influenced by the method of multilocus sequence typing (MLST), proposed in 2008 and analyzing the spatial distribution of sequence types (STs). Despite the fact that Russia is the largest natural focus of LB to date, it is represented by only 3 strains of the 1323 strains deposited in the MLST database. In this paper, we identified STs for 24 B. burgdorferi s.l. strains isolated from ticks from almost all regions of Russia, 16 of which have not been described so far. It has been shown that the Russian isolates of B. afzelii are of Asian origin and are characterized by a lack of territorial mixing of STs. In contrast, B. garinii and B. bavariensis showed ST mixing between different localities. Comparison of MLST data with the results of sequence analysis of rrf–rrl intergenic spacer led to the conclusion that the previously described genomic groups of B. garinii correspond to the genospecies according to the new classification: 20047 corresponds to B. garinii, and NT29 corresponds to B. bavariensis. The genomic group, ChY13p, characterized by an unusual PCR-RFLP profile, belongs to the species B. garinii (prototype strain 20047). Thus, the use of a reliable method to study the phylogeny and evolution of Borrelia based on MLST, helps to clarify the existing classification. The standardized research procedure and database created could become the basis for a global scientific cooperation in LB research.
Надо заметить, как раз кстати. Стоит замечательная погода, и интерес к клещам просыпается одновременно с ними. Призываем всех соблюдать осторожность во время отдыха на природе (но не чересчур)! Таким образом, клещевой сезон 2013 можно считать открытым!
09.01.2013 Уважаемые научные сотрудники и преподаватели! Поздравляем с Днем российской науки, который мы праздновали 8 февраля! Больших творческих успехов, идей, публикаций в высокоимпактных журналах!
Не без связи с этим радостным событием (который омрачается скандалами с фиктивными диссертациями и перспективой отказа от доплаты кандидатам и докторам надбавок за ученую степень) хотим поделиться впечатлениями от прошедшей неделю назад школы Future Biotech, в которой участвовала аспирантка лаборатории Мухачева Татьяна.
04. 01. 2013 Поздравляем с Новым годом и Рождеством!!! Коллектив ЛМГ желает всем здоровья, процветания и творческих успехов!